能引起手足口病的病原型别很多，但均属于微小核糖核酸病毒科、人肠道病毒属。
人是本病的传染源，患者、隐性感染者和无症状带毒者为该病流行的主要传染源。流行期间，患者是主要传染源。健康带毒者和轻型散发病例是流行间歇和流行期的主要传染源。
主要是通过人群间的密切接触进行传播的。患者咽喉分泌物及唾液中的病毒，可通过空气飞沫传播。
唾液、疱疹液、粪便污染的手、毛巾、手绢、牙杯、玩具、食具、奶具以及床上用品、内衣等，通过日常接触传播，亦可经口传播。
与患者同一室最易感染。接触被病毒污染的水源，也可经口感染，并常造成流行。门诊交叉感染和口腔器械消毒不严也可造成传播。
潜伏期一般2-7天，没有明显的前驱症状：多数病人突然起病。
约半数病人于发病前1-2天或发病的同时有发热，多在38℃左右。
主要侵犯手、足、口、臀四个部位；因为疹子不像蚊虫咬、不像药物疹、不像口唇牙龈疱疹、不像水痘所以又称四不像；而临床上更有不痛、不痒、不结痂、不结疤的四不特征。
口腔粘膜疹出现比较早，起初为粟米样斑丘疹或水疱，周围有红晕，主要位于舌及两颊部，唇齿侧也常发生。手、足等远端部位出现或平或凸的班丘疹或疱疹。
手足口病表现在皮肤和口腔上，但病毒会侵犯心、脑、肾等重要器官。
1.实验室检查
周围血象中的细胞总数一般正常或偏高，分类淋巴细胞较高，中性粒细胞较低。有中枢神经系统合并症时，脑脊液细胞数可增多，蛋白升高。
2.病原学检查
3.分子生物学检查
近年来，PCR技术已成为诊断肠道病毒感染最常用的一种方法。
治疗手足口病中药效果较好，一般用内服药和口腔涂药相结合，无并发症者一周左右即可治愈，预后良好。
也可采用抗病毒药物治疗。
本病至今尚无特殊预防方法，加强监测，提高监测敏感性是控制本病流行的关键。
一、做好疫情报告，及时发现病人，积极采取预防措施，防止疾病蔓延扩散。
二、托幼等单位做好晨间体检，发现疑似病人，及时隔离治疗。
三、对被污染的日常用品、食具等应消毒处理。
四、在手足口病流行时，应做好环境卫生、食品卫生和个人卫生。饭前便后要洗手，预防病从口入。
五、家长尽量少让孩子到拥挤公共场所，减少被感染机会。还要注意婴幼儿的营养、休息，避免日光曝晒，防止过度疲劳，降低机体抵抗力。
六、医院应加强预诊，设立专门诊室，严防交叉感染。
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