导致自然流产的原因很复杂，早期自然流产较为常见的原因为染色体异常、内分泌异常、子宫发育不良或畸形。其他的原因有血型不合、精神神经因素、母体全身性疾病、免疫因素等。

　　（一）超声诊断

　　一般在孕5～6周可见胎囊，孕6～7周可见胎芽。

　　当临床尚无自然流产征象时，经超声检查即可发现枯萎孕卵。

　　超声诊断可分辨各种自然流产：先兆自然流产、难免自然流产、不全自然流产、完全自然流产、稽留自然流产。

　　（二）阴道细胞学

　　绒毛膜合体细胞在涂片中的出现倾向于发生自然流产。

　　妊娠期阴道涂片中核固缩指数升高表示孕激素不足。

　　（三）宫颈粘液结晶

　　雌激素能产生宫颈粘液结晶，而孕激素对结晶则有抑制作用。因此，在孕期检查宫颈粘液结晶可测知自然流产的预后。

　　（四）基础体温

　　早期妊娠应保持高温曲线持续16周左右，逐渐正常。

　　有自然流产先兆时如基础体温与正常妊娠相同，预后良好，若较正常妊娠降低者，预后不良。

　　（五）激素测定

　　由于内分泌异常所致自然流产，可根据不同情况测定激素，如疑黄体功能不全，可测定孕二醇，观察动态变化选择适当方法治疗。

　　一、染色体异常

　　染色体异常包括染色体数目异常，如单体、三体、多倍体；结构异常，如断裂、缺失、易位均可致自然流产。

　　有人对自然流产和治疗性流产进行染色体的研究，发现在自然流产中核型异常者占60%，核型异常者每伴有胎儿或胎盘等一种结构上的异常。而核型正常者自然流产的胎儿多正常。

　　二、内分泌失调

　　雌激素过多与孕酮不足亦为早期自然流产的原因。因在妊娠12～14周，易有内分泌失调尤其是黄体功能不足。

　　此外，甲状腺素缺少使细胞的氧化过程遭受障碍，以及甲状腺机能亢进与糖尿病等皆易发生自然流产。

　　三、胎盘异常与胎盘内分泌不足

　　早期妊娠时的胎膜炎可使底胎膜出血或增生，绒毛内血管阻塞，影响营养物质的吸收与运送，以致孕卵从附着处分离、出血而自然流产。

　　此外如胎盘内巨大梗塞，可使胎盘功能降低，影响胎儿生存；

　　而前置胎盘、胎盘绒毛水肿变性致成自然流产者亦不少见。

　　妊娠后母血中β-hCG、hPL、PE2雌酮，早孕时如这些激素值下降，则50%自然流产。

　　四、血型不合

　　由于以往妊娠或输血，致Rh因子、不合的ABO血型因子在母体中产生抗体，此次妊娠由胎盘进入胎儿体内，与红细胞凝集而产生溶血，以致自然流产。

　　五、精神神经因素

　　如惊吓、严重精神刺激等，也都可致成自然流产。近年来通过研究认为噪音与振动对人的生殖有一定影响。

　　六、母体全身性疾病

　　（一）严重的急性传染病和感染疾病：

　　如大叶性肺炎多伴发生高热，导致子宫收缩，或胚胎死亡，均可致自然流产。

　　（二）慢性疾病：

　　严重贫血、心脏病、心力衰竭可引起胎儿缺氧、窒息而死亡；

　　慢性肾炎、严重高血压可使胎盘发生梗死或早剥离，而引起自然流产。

　　（三）营养不良或药物中毒：

　　如维生素缺乏特别是维生素E—生育醇的缺乏，汞、铅酒精及吗啡等慢性中毒，均可引起自然流产。

　　七、生殖器官疾病

　　子宫畸形，如双角子宫、子宫腔纵隔常为自然流产的原因。

　　此外如子宫肌瘤，尤其是向子宫腔内发展的粘膜下肌瘤或嵌顿在盆腔中的卵巢囊瘤，均可影响胎儿的发育，而导致自然流产。

　　子宫内口松弛为习惯性自然流产常见原因之一。

　　近年来发现宫腔粘连患者中，约14%发生在自然流产。因粘连引起宫腔缩小、变形和子宫内膜面积减少，影响胚胎发育。

　　八、免疫因素

　　对原因不明者，近年来研究发现多数与免疫因素密切相关。

　　（一）组织相容抗原：

　　正常妊娠时夫妇组织相容抗原不相容，可维持遗传的多样性。而习惯性自然流产夫妇间组织相容抗原相容的频率大于正常妊娠者。母体免疫系统易对胎儿产生免疫学攻击而导致自然流产。

　　（二）抗磷脂抗体：

　　近年来研究发现，在自身免疫性疾病，某些感染、药物，或不明原因的疾患中如抗磷脂抗体阳性，习惯性自然流产发生率极高。

　　（三）抗精子抗体：

　　在反复自然流产夫妇中，研究发现双方或男方血清中的抗精子抗体。

　　抗精子抗体引起的自然流产，多发生在3个月以内的早期自然流产。